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美國科學院院報:暴發(fā)根源A類毒株相當多見于非東亞地區(qū)
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柳葉刀不愛吃魚的大狗
最后更新: 2020-04-13 12:02:52【文/觀察者網(wǎng) 程小康】新冠病毒到底從哪里來?一直是國內(nèi)外輿論關注的焦點。因為武漢疫情最先爆發(fā),美國的一些政客在公開場合總是嚷嚷著“武漢病毒”、“中國病毒”,試圖污名化中國。
近期,關于新冠病毒起源問題的研究有了新進展。最新的研究發(fā)現(xiàn),新冠A類與C類毒株相當多的比例在東亞以外地區(qū)被發(fā)現(xiàn),B類在東亞國家,尤其中國大陸境內(nèi)常見。
A類病毒相當多發(fā)現(xiàn)于非東亞地區(qū)
4月8日,一篇由英國和德國學者共同撰寫的論文,在國際知名學術期刊《美國科學院院報》(PNAS)上發(fā)表,文章題為《Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes》,第一作者為劍橋大學的Peter Forster博士。
截圖自《美國科學院院報》官網(wǎng)
論文內(nèi)容顯示,研究人員按照進化關系,將新冠病毒變種分為A、B、C三類,A類與C類有相當多比例在東亞以外地區(qū)被發(fā)現(xiàn)。相反,B類是東亞最常見的類型,B類的原始類型似乎沒有傳到東亞以外,直到最初的突變產(chǎn)生B類衍生型后才傳出去。這一現(xiàn)象指向奠基者效應或東亞以外對B類原始型在免疫上或環(huán)境上的抗性。
2月3日,中國科學院武漢病毒研究所在《自然》雜志上發(fā)表的題為《A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin》論文,新冠病毒的基因組與蝙蝠冠狀病毒序列RaTG13相比,具有近96%的相似性。基于此研究,Peter Forster博士的研究團隊,在其論文中將蝙蝠攜帶的冠狀病毒設定為起源。
截圖自《自然》雜志官網(wǎng)
該研究團隊使用了160個完成的病毒基因樣本,標記為A、B、C三類。這些樣本在2019年12月24日至2020年3月4日期間,采集自世界各地。
因為A類毒株與蝙蝠身上的冠狀病毒序列RaT13G相似,該研究團隊將A類設定為“暴發(fā)根源(the root of the outbreak)”。
該論文指出,根據(jù)同一突變T29095C,A類可以明顯分為兩個子簇。在T突變子簇里,四個中國個體(來自華南沿海省份廣東)攜帶原始類型,三個日本和兩個美國病人與之不同,有一些突變差異。這些美國病人都有武漢居住史。
C突變子簇里有相當長的突變分支,包括5個武漢個體,其中兩個顯示在原始節(jié)點里。還包括8個來自中國和鄰國的東亞人。在C突變子簇里幾乎一半的類型(15/33),在東亞以外被發(fā)現(xiàn),主要在美國和澳大利亞。
論文數(shù)據(jù)表格
在論文的原始數(shù)據(jù)表格里, 針對C突變子簇,中國有12個(標紅),包括臺灣、香港個1個。美國7個(標藍),澳大利亞5個(標紫),歐洲3個(標綠),除東亞外的東亞國家6個(標白)??梢姡珻突變子簇中,非東亞國家占比15/33。
B類型病毒是包括中國在內(nèi)的東亞國家主要傳播類型,其中中國內(nèi)地占大多數(shù)。最后一種C類病毒,是歐洲的主要類型,在法國、意大利、瑞典和英國的早期病患中都有發(fā)現(xiàn),160個樣本中,中國大陸地區(qū)沒有出現(xiàn)該類型病毒,但在中國香港、中國臺灣、新加坡、韓國有發(fā)現(xiàn)。
值得注意是,有業(yè)內(nèi)專家指出,蝙蝠冠狀病毒序列RaTG13與新冠病毒雖然接近,但要用來確定“祖先”還差得太遠。
對于該篇論文,英國愛丁堡大學的分子進化生物學家Andrew Rambaut,連發(fā)推特,提出強烈質(zhì)疑:“這篇文章有許多地方都犯了大錯,包括內(nèi)容、發(fā)現(xiàn)和發(fā)布的途徑”、“首先是試圖用蝙蝠病毒RaTG13給新冠樹定根。這是最接近的非人病毒,但和新冠仍有超過1100個核苷酸的差異。然而請注意,由于某些原因,圖上連蝙蝠的分支比1100個核苷酸短些”、“實際上,關于內(nèi)容我想說的就這么多,根定錯了,所有的結論(包括《每日郵報》里的那些)都得不到支持了”。
- 責任編輯: 柳葉刀 
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